El kefir de agua está compuesto típicamente de bacterias de Lactobacillus, Streptococcus, Pediococcus y Leuconostoc con levaduras de Saccharomyces, Candida, Kloeckera y posiblemente otras levaduras menores.
Bacteria
Especies Lactobacillus
- L. acidophilus
- L. alactosus
- L. brevis
- L. bulgaricus
- L. casei subsp. casei
- L. casei subsp. pseudoplantarum
- L. casei subsp. rhamnosus
- L. casei subsp. tolerans
- L. coryneformis subsp. torquens
- L. fructosus
- L. hilgardii
- L. homohiochi
- L. plantarum
- L. psuedoplantarum
- L. reuterietc
- L. yamanashiensis
- S. agalactiae
- Sr. bovis
- S. cremeris
- S. faecalis
- S. lactis
- S. mutans
- S. pneumoniae
- S. pyogenes
- S. salivarius
- S. sanguinis
- S. suis
- S. viridans
- P. damnosus
- L. mesenteroides
- B. subtilis
- B. graveolus
Levaduras
Especies Saccharomyces
- S. bayanus
- S. boullardii
- S. cerevisiae
- S. florentinus
- S. pretoriensis
- S. uvarum
- K. apiculata
- H. yalbensis
- C. gueretana
- C. lamica
- C. valida
Especies Torulopsis
- T. insconspicna