Diversidad genómica y distribución global de Saccharomyces eubayanus, el ancestro salvaje de las levaduras híbridas de elaboración de cerveza.
Quinn K. Langdon, David Peris, Juan I. Eizaguirre, Dana A. Opulente, Kelly V. Buh, Kayla Sylvester, Martin Jarzyna, María E. Rodríguez, Christian A. Lopes, Diego Libkind, Ver ORCID ProfileChris Todd Hittinger
S. eubayanus, el progenitor salvaje y tolerante al frío de las levaduras híbridas de cerveza lager, tiene una historia natural compleja y poco estudiada. La exploración de esta diversidad se puede utilizar tanto para desarrollar nuevas aplicaciones de elaboración de cerveza como para ilustrar nuestra comprensión de la dinámica de la evolución de la levadura en la naturaleza. Aquí, integramos la secuencia del genoma completo y los datos fenotípicos de 200 cepas de S. eubayanus, la colección más grande hasta la fecha. S. eubayanus tiene una estructura de población de múltiples capas, que consta de dos poblaciones principales que están estructuradas en seis subpoblaciones. Cuatro de estas subpoblaciones se encuentran exclusivamente en la región patagónica de América del Sur; uno se encuentra predominantemente en la Patagonia y escasamente en Oceanía y América del Norte; y una es específica de la ecozona holarctica. S. eubayanus es más abundante y genéticamente diverso en la Patagonia, donde algunos lugares albergan más diversidad genética que la que se encuentra fuera de América del Sur. Todas las subpoblaciones, excepto una, muestran aislamiento por distancia y el flujo de genes entre las subpoblaciones es bajo. Sin embargo, hay señales fuertes de cruzamientos antiguos y recientes, incluyendo dos linajes mezclados, uno que es simpático y uno que está mayormente aislado de sus poblaciones parentales. A pesar de la extensa diversidad genética de S. eubayanus, tiene una diversidad fenotípica relativamente pequeña y todas las subpoblaciones se realizaron de manera similar en la mayoría de las condiciones evaluadas. Utilizando nuestros extensos datos biogeográficos, construimos un modelo sólido que predijo todas las regiones conocidas del mundo y un puñado de regiones adicionales que son climáticamente adecuadas para S. eubayanus, incluida Europa. Llegamos a la conclusión de que esta especie de importancia industrial tiene una rica diversidad silvestre con muchos factores que contribuyen a su compleja distribución y biología.